Curso BMM xxx "Microscopia automatizada"
Prof. Jean C Houzel. Lab de Fronteiras em Neurociências - PNBC/PCM - ICB-UFRJ
BMXXX : Microscopia automatizada
Docente responsável: Jean-Christophe Houzel
Participação: Sheila do Nascimento Silva (Profa IBCCF);
Thiago Marques de Melo (IC LabFN).
Número de alunos : 6 Max
Horário: à combinar, em 15 blocos de 3 horas.
Carga horária: 45 horas // Numero de créditos : 3

Local : Lab de Neuroplasticidade (ICB) ; e Lab de Neurobiologia 2 (IBCCF), para as aulas
10 e 11. As aulas 14 e 15 serão na forma de webinars.
Objetivo: Este curso téorico-prático visa a habilitar os alunos a usar ferramentas avançadas de microscopia automatizada para realizar seus projetos de pesquisa. A prática será focada no uso do sistema Neurolucida (MBFbioscience*).
Requisitos: Cada aluno deverá fazer uma curta apresentação do seu projeto (com ou sem dados preliminares).
Ementa:
0- Apresentação do curso e dos mini-projetos.
1- Bases da microscopia óptica e de fluorescência.
2- Definição de parâmetros quantitativos e estratégia de aquisição.
3- Métodos de análise de microfotografias ou imagens digitais: vantagens e limites.
4- A câmera clara tradicional: vantagens e limites.
5- O sistema Neurolucida : conceito, histórico, hardware e software.
6- Neurolucida: calibração, menus principais, objetos, customização.
7- Definição de projetos dos alunos com seu próprio material.
8- Serial Section Manager: Trabalhando com cortes seriados.
9- NeuroExplorer: análises morfométricas quantitativas.
10-VirtualTissue: otimizar rotinas de virtualização 2D, 3D e 3,5D do tecido.
11-ImageStack: importação de pilhas adquiridas nos microscopios confocais do CCS.
12- SolidModelling: representação e modelagem.
13- Estereologia: histórico, conceitos e algoritmos, sondas.
14- Perspectivas1: StereoInvestigator (estereologia automatizada).
15- Perspectivas2: AutoNeuro (rastreamento automático de fibras e estruturas ramificadas).
16- Discussão geral e avaliação dos projetos. Outros módulos (MRI, Microlucida, Densita).
* MBFbioscience : http://www.mbfbioscience.com/product

atualização: 13/03/2012
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